سازمان برای اجرای اهداف اصلی زیرطبق اساسنامه تشکیل گردیده است
الف- حفظ ونگهداری و اداره امور پایانه ها .
ب ـ تجهیز و توسعه پایانه ها با استفاده از ابزار و روشهای پیشرفته ومتناسب با افزایش رشد جمعیت .
ج ـ در صورت لزوم احداث پایانه های جدید در مبادی ورودی ومکانهای مناسب شهر در چهارچوب لایحه قانونی احداث پایانه های مسافربری مصوب اردیبهشت ماه 59 و ماده واحده مصوب سال 72 مجلس شورای اسلامی ودستورالعمل اجرائی تبصره 2 اصلاحی قانون نحوه واگذاری غرف موجود در پایانه ها مصوب هیأت محترم وزیران در سال 74 .